Co to jest Enhancer?

Definicja Enhancer:

Enhancer to krótki fragment lub sekwencja DNA, która działa w celu zwiększenia lub przyspieszenia tempa transkrypcji genetycznej. Wzmacniacz jest również często nazywany elementem cis-regulacyjnym i ma rozmiar od 20 do 400 par zasad DNA.

Położenie:

Wzmacniacz może być zlokalizowany zarówno upstream jak i downstream danego genu i może być w tej samej lub innej orientacji w stosunku do genu, który ma być transkrybowany. Wzmacniacz nie musi znajdować się w pobliżu miejsca inicjacji transkrypcji, aby funkcjonować. Enhancery są obecne i funkcjonują zarówno w komórkach prokariotycznych, jak i eukariotycznych. Enhancery mogą znajdować się na intronach i egzonach oraz mogą działać na geny innego chromosomu.

Funkcja:

Do enhancera przyłącza się czynnik transkrypcyjny, który pomaga stymulować transkrypcję genu. Enhancery, w rzeczywistości, nie działają bezpośrednio na promotory, ale muszą być najpierw przyłączone do czynników transkrypcyjnych. Wzmacniacze mogą być oddalone o tysiące zasad od miejsca inicjacji transkrypcji. Jest to możliwe dzięki temu, jak działają enhancery. Czynniki transkrypcyjne najpierw wiążą się do enhancera. Następnie białko zginające DNA przybliża enhancer do promotora w procesie znanym jako zapętlenie DNA. Wzmacniacze zwiększają lub przyspieszają tempo transkrypcji poprzez zbliżenie aktorów transkrypcyjnych do promotora. Enhancery mogą również regulować więcej niż jeden gen, niezależnie od ich orientacji względem genów lub genów. Enhancery są również ważnym elementem genetycznym w rozwoju, ponieważ mogą przyczynić się do zwiększenia aktywacji transkrypcji w komórkach.

Znaczenie:

Niektóre enhancers mogą odgrywać rolę w ludzkiej choroby i badania sugerują, że cis-regulatory mogą rzeczywiście zwiększyć ryzyko chorób, takich jak cukrzyca typu 2, choroby układu krążenia i raka jelita grubego.

Przykłady Enhancer:

Przykładem enhancera genu, który został odkryty jest HACNS1, który jak się uważa miał rolę w ewolucji ludzkiego kciuka. Innym przykładem enhancera jest proksymalny enhancer epiblastu (PEE), który jest ważnym enhancerem podczas rozwoju ciała kręgowców.

Co to jest Promotor?

Definicja Promotor:

Promotory to fragmenty sekwencji DNA, które wskazują miejsce rozpoczęcia transkrypcji DNA przez polimerazę RNA. Promotory biorą udział w inicjowaniu lub rozpoczynaniu transkrypcji genetycznej, ponieważ określają, która nić DNA będzie transkrybowana (tj. która nić jest nicią sensu), oraz w którym kierunku nastąpi transkrypcja.

Położenie:

Promotory znajdują się zwykle w górę od początku transkrypcji na 5’końcu miejsca, w którym rozpoczyna się transkrypcja. Promotory muszą znajdować się w pozycji 5’w pobliżu genu, który ma być transkrybowany. 5’koniec DNA odnosi się do nici DNA, która kończy się na 5’węglu. Promotory występują zarówno w komórkach prokariotycznych, jak i eukariotycznych.

Funkcja:

Promotory wiążą się zarówno z enzymem polimerazą RNA, jak i z czynnikami transkrypcyjnymi.Promotor inicjuje proces transkrypcji poprzez oddziaływanie z polimerazą RNA i czynnikami transkrypcyjnymi. Enzym polimeraza RNA słabo wiąże się z sekwencją DNA i przesuwa się wzdłuż nici, aż napotka promotor. Na tym etapie tworzy następnie z promotorem zamknięty kompleks. Następnie polimeraza RNA przystępuje do rozwijania DNA w miejscu inicjacji lub startu transkrypcji, tworząc otwarty kompleks promotora. Następnie inicjowana jest transkrypcja.

Znaczenie:

Niektóre genetyczne promotory mogą być implikowane i zaangażowane w choroby. Wariacje w promotorach mogą być związane z pewnymi chorobami, takimi jak beta-talasemia i astma.

Przykłady promotorów:

Wiele komórek eukariotycznych posiada ważną część promotora znaną jako pole TATA, które można znaleźć od 25 do 35 zasad w górę od miejsca rozpoczęcia transkrypcji. Odkryto kilka przykładów promotorów. Niektóre z nich są ważne w rozwoju nowotworów. Na przykład promotor PEG-3 i ludzkiej odwrotnej transkryptazy telomerazy (hTERT), które znajdują się w komórkach nowotworowych.

Różnica między Enhancerem a Promotorem?

Definicja

Wzmacniacz to fragment DNA, który zwiększa transkrypcję genu. Promotor to fragment DNA, który działa w celu zainicjowania lub rozpoczęcia transkrypcji genu.

Wiąże się z

Wzmacniacz wiąże się z czynnikami transkrypcyjnymi, natomiast promotor wiąże się z czynnikami transkrypcyjnymi i enzymem polimerazą RNA.

Lokalizacja

Wzmacniacz może być w górę lub w dół od miejsca inicjacji transkrypcji, podczas gdy promotor jest zawsze w górę od miejsca inicjacji transkrypcji.

Odległość

Wzmacniacz nie musi być blisko miejsca, gdzie inicjowana jest transkrypcja, podczas gdy promotor musi być blisko miejsca, gdzie inicjowana jest transkrypcja.

Funkcja

Wzmacniacz działa w celu wzmocnienia lub zwiększenia transkrypcji, podczas gdy promotor działa w celu zainicjowania procesu transkrypcji.

Znaczenie

Enhancers są uważane za związane z chorobami takimi jak cukrzyca typu 2, choroby układu krążenia i raka jelita grubego. Promotory są uważane za związane z chorobami takimi jak astma i beta-talasemia.

Przykłady

Przykłady enhancerów obejmują HACNS1 i PEE. Przykłady promotorów to promotor PEG-3 i ludzka telomerazowa odwrotna transkryptaza (hTERT).