Czym są sekwencjonowanie genomu i mapowanie genomu?
Zarówno mapa genomu jak i sekwencjonowanie genomu to ryciny genomu.
Mapowanie genomu pomaga w rozpoznaniu i identyfikacji locus genów oraz odległości między nimi. Metoda ta oferuje krytyczny punkt wyjścia dla międzynarodowego projektu badań naukowych – HGP i.e., Human Genome Project. Strategie mapowania obejmują – mapowanie fizyczne niskiej rozdzielczości, mapowanie fizyczne wysokiej rozdzielczości, Enzymy restrykcyjne: Microscopic Scalpels, wykorzystanie map powiązań genetycznych, Macro restriction maps: Top-down mapping, Contig maps: Mapowanie bottom-up, Rozdzielanie chromosomów (sortowanie przepływowe i hybrydyzacja komórek somatycznych
Sekwencjonowanie genomu jest metodą jednorazowej oceny pełnej sekwencji kwasu deoksyrybonukleinowego genomu żywej istoty. Sekwencjonowanie genomu jest również określane jako sekwencjonowanie całego genomu. Strategie sekwencjonowania obejmują – metodę klon po klonie (dla większych genomów, np. genomów eukariotycznych) oraz sekwencjonowanie całego genomu metodą shotgun (nie wymaga mapy genomu).
Metoda ta jest wykorzystywana jako narzędzie badawcze pomocne w interwencjach leczniczych lub terapeutycznych.
Podobieństwo
Do podobieństw między sekwencjonowaniem genomu a mapowaniem genów należą;
Sekwencjonowanie genomu
Sekwencjonowanie genomu to metoda oceny sekwencji kwasów nukleinowych (makrocząsteczek występujących we wszystkich komórkach i wirusach) – kolejności nukleotydów (podstawowego budulca kwasów nukleinowych) w DNA. Jest ona pomocna w ustaleniu kolejności 4 związków biologicznych zawierających azot w DNA: adeniny (A), guaniny (G), cytozyny (C) i tyminy (T)
Mapowanie genomu
Jest to anatomia ludzkiego genomu. Mapy genetyczne są pomocne w określeniu kolejności markerów wzdłuż chromosomów (długa cząsteczka kwasu dezoksyrybonukleinowego zawierająca część lub cały materiał genetyczny organizmu) genomu.
Różnica między sekwencjonowaniem genomu a mapowaniem genomu
Opis
Sekwencjonowanie genomu
Sekwencjonowanie genów polega na identyfikacji każdego nukleotydu (cząsteczki organicznej, która jest budulcem kwasu dezoksyrybonukleinowego i kwasu rybonukleinowego) w danym segmencie DNA. Sekwencjonowanie genów oferuje bardziej wszechstronne i kompletne szczegóły dotyczące genomu.
Mapowanie genomu
Mapowanie genomu lub mapowanie genów to tworzenie mapy genetycznej oraz pobieranie fragmentów kwasu dezoksyrybonukleinowego i przypisywanie ich do różnych chromosomów.
Metody
Sekwencjonowanie genomu
- Sekwencjonowanie metodą Shotgun
- Pirosekwencjonowanie
- Sekwencjonowanie nanopiłek DNA
- Sekwencjonowanie pojedynczych cząsteczek za pomocą Heliscope
- Sekwencjonowanie w czasie rzeczywistym pojedynczych cząsteczek (SMRT)
- Nanoporowe sekwencjonowanie DNA
Mapowanie genomu
- Badanie historii rodziny (rodowodów)
- Eksperymenty krzyżowania
- Techniki biologii molekularnej
- Analiza powiązań
- Mapowanie STS
- FISH
- Mapowanie restrykcji
- Odwzorowanie odcisków palców
Zalety
Sekwencjonowanie genomu
Mapowanie genomu
- Leki
- Dostosowania rolnicze – ulepszone rolnictwo i zwierzęta gospodarskie
- Diagnoza choroby/chorób
- Lepsze zrozumienie ewolucji i migracji ludzi
- Energia i środowisko
- Kryminalistyka
- Dokładniejsza ocena ryzyka
Szczegółowość
Sekwencjonowanie genomu
Szczegóły uzyskane przez sekwencjonowanie genów oferują kompletne i wszechstronne szczegóły
Mapowanie genomu
Szczegóły uzyskane przez mapowanie genów oferują mniej szczegółów
Czas i koszty
Sekwencjonowanie genomu
Jest to metoda bardzo kosztowna i czasochłonna.
Mapowanie genomu
Mapowanie genomu nie jest drogie i jest tanią metodą. Zajmuje również bardzo mało czasu.
Podsumowanie
Punkty różnic pomiędzy sekwencjonowaniem genomu a mapowaniem genomu zostały podsumowane jak poniżej: